C’est en 1905 que les sœurs de la Charité de sainte Jeanne-Antide (Besançon) sont venues à Baabdath pour s’occuper de l’éducation de la jeunesse. En 1911, elles achetèrent un terrain (parcelle 427) et y construisirent une école qui a été inaugurée en 1913. Aux classes du préscolaire et du primaire, s’ajoutèrent les classes du complémentaire, dans le nouveau bâtiment. En 1988 le cycle secondaire fut ouvert d’abord pour les filles avant de devenir mixte en 2002.
Progressivement, les bâtiments centenaires ont été rénovés et restructurés. Ainsi, le laboratoire scientifique, la salle d’informatique la salle audio-visuelle, l’oratoire, la salle d’activités ont été embellis durant la première phase des travaux. En 2009, la cour du préscolaire a été refaite. En 2011, un grand chantier de restructuration, financé par une association, a permis l’innovation du bureau de la psychologue, de l’assistante sociale, de l’infirmerie ainsi que l’élargissement des classes secondaires. Un autre chantier parallèle a permis la création d’une cafétéria, d’une salle de réunion ainsi que le renouveau des toilettes de la cour du primaire.. En été 2014, a eu la troisième phase des travaux et qui a rénové les toilettes du cycle préscolaire ainsi que la chapelle, la buanderie et la salle de rythmique.
Depuis 2005, l’école est gérée par un conseil de direction. Un RDC et un préfet de discipline sont nommés à la tête de chaque cycle. La direction a réévalué le règlement intérieur et introduit plusieurs programmes éducatifs.
L’école compte actuellement 700 élèves depuis la maternelle jusqu’aux classes secondaires. Chaque classe est repartie en 2 sections. Les élèves des classes terminales s’orientent vers 3 branches « Science de la vie », « Sciences générales », « Lettres et Humanité ».
